10月16日～18日，由國家食品藥品監管局牽頭，國家發改委、衛生部等部委有關人員組成的國務院藥品整治專項行動第一督查組一行9人，深入北京市大興區亦莊以及宣武、昌平等區縣的藥品、醫療器械生產經營企業，基層醫療機構及藥品監管部門，就北京市藥品整治專項行動進展情況和完成質量進行了督導檢查。督查組對北京市藥品專項整治工作做出了積極評價，并要求北京市繼續加大工作力度，把專項整治不斷推向深入，切實做好2008年奧運會期間藥品安全和保障工作。
督查組在聽取工作匯報、查看資料的基礎上，先后到北京同仁堂股份有限公司亦莊生產基地、北京京精醫療設備有限公司、北京雙鶴藥業、北京萬東醫療、北京醫藥股份有限公司物流中心以及北京市藥品監管局宣武分局、昌平分局等10多家單位進行了實地檢查和座談，并對昌平區農村藥品“兩網”建設情況進行了現場調研。督查組認為，北京市有條不紊、扎扎實實地開展了藥品和醫療器械注冊、生產、流通和使用環節的專項整治，預計可按期完成各項任務。北京市藥品監管局作為專項整治牽頭部門，與政府相關部門密切合作，形成合力，進一步凈化了首都藥品市場。同時，北京市將專項行動與奧運保障工作相結合，在藥品生產環節開展了“閃電行動”，在藥品流通環節開展了“颶風行動”，各項工作都有創新，藥品監管水平不斷提升，藥品市場秩序進一步規范，專項整治取得了顯著成效。
督查組希望北京市繼續深入推進專項整治，確保各項措施落到實處。同時，要進一步創新監管思路和監管手段，建立藥品監管長效機制，切實保障公眾用藥安全有效；進一步完善部門聯動、協調配合的長效工作機制，鞏固專項整治成果；按照北京市委、市政府統一部署，結合專項整治，采取有力措施，切實保障2008年奧運會期間藥品市場安全和供應，務求萬無一失。督查組要求北京市各相關部門，在奧運會前對全市興奮劑生產經營情況進行全面排查，堅決取締非法生產經營蛋白同化制劑和肽類激素，杜絕零售藥店違法銷售除胰島素以外的該類產品，嚴防奧運會期間出現藥源性興奮劑管理問題。